天地之化，自然生生不窮，更何資於既斃之形，已反之氣”同。殊與質力不滅之理相背，不免陷於斷絕之譏。
朱子之論陰陽，亦以為同體而異用，與橫渠同。語錄曰：“陰陽只是一氣。陽之退，便是陰之生。不是陽退了，又別有個陰生。”答楊元範曰：“陰陽只是一氣。陰氣流行即為陽，陽氣凝聚即為陰。非直有二物相對”是也。
陰陽亦人之觀念，而非實有其物，故逐細分析，可以至於無窮。（人非分別不能認識。凡人所認識，皆有彼此之分，即可以陰陽名之）此理朱子亦見及。《語類》：“統言陰陽只是兩端，而陰中自分陰陽，陽中亦有陰陽。乾道成男，坤道成女。男雖屬陽，而不可謂其無陰；女雖屬陰，而不可謂其無陽。人身氣屬陽，而氣有陰陽；血屬陰，而血有陰陽”云云。此說殊有裨於實用。知此，則知大小善惡等，一切皆比較之詞，而非有一定之性質。以臨事，不滯固矣（如人之相處，凌人為惡，見凌於人為善，此通常之論也。然世實無凌人之人，亦無見凌於人之人，視所值而異耳。甲強於乙，則凌乙，而乙不敢凌甲。則甲為凌人之人，而乙為見凌於人之人。然丙弱於乙，乙又將凌之；丁更強於甲，亦不免凌甲；則甲又為見凌於人之人，乙又為凌人之人矣。知此，則知世無真可信之人，亦無真可託之國。同理，亦無真不可信之人，真不可託之國。吾國當日俄戰前，群思倚日以排俄；德日戰後，又欲結美以攘日；近日高唱打倒帝國主義，則又不分先後緩急，欲舉外人一切排之；皆不知此等理誤之也。故哲學思想真普及，則群眾程度必增高）。
凡言學問，必承認因果。因果者，現象界中，自然且必然之規律也。此規律，以時間言，則不差秒忽；以空間言，則不爽毫釐；此為舊哲家所謂數。朱子之思想亦如此。《語類》雲：“有是理，便有是氣；有是氣，便有是數。”又云：“數者，氣之節候”是也。
理學家之所謂理，非普通人之所謂理也。普通人之所謂理，乃就彼所知之事，籀繹得之，約略言之而已。至理學家之所謂理，則必貫通萬事而無礙，乃足以當之。蓋就知識言，必於萬事萬物，無所不曉，而其所知乃真；以行為言，必其所知既真，而所行始可蘄其不繆也。此等思想，在今日科學既明，固已知其徒存虛願。然在昔日，哲學家之願望，固多如是。職是故，理學家之於物理，亦多有格致之功。以此雖非急務，固亦在其學問之範圍內也。朱子之好學深思，實非尋常理學家所及。故於物理，探索尤勤，發明亦多。衡以科學，固多不足信。然自是當時哲學家一種見解，而於其學問宗旨，亦多有關係，固不可以不知也。今試略述其說如下： 朱子推想宇宙之生成，亦以陰陽五行之說為本。其言曰：“天地始初混沌未分時，想只有水火二者。水之滓腳便成地。今登高而望，群山皆為波浪之狀，便是水泛如此。只不知因什麼事凝了。初間極軟，後方凝得硬。問：想得如潮水湧起沙相似。曰：然。水之極濁便成地。火之極清，便成風雲雷電日星之屬。”又曰：“大抵天地生物，先其輕清，以及重濁。天一生水，地二生火，二物在五行中最輕清。金木重於水火，土又重於金木。”又論水火木金土之次曰：“竊謂氣之初，溫而已。溫則蒸溽，蒸溽則條達，條達則堅凝，堅凝則有形質。五者雖一有俱有，然推其先後之序，理或如此。”又曰：“天地初開，只是陰陽之氣。這一個氣執行，磨來磨去。磨得急了，便拶許多渣滓。裡面無處出，便結成個地在中央。氣之清者，便為天，為日月，為星辰，只在外常周環運轉。地便在中央不動，不是在下。”又曰：“造化之運如磨。上面常轉而不止。萬物之生，似磨中撒出。有粗有細，自是不齊。”又曰：“晝夜運而無息，便是陰陽之兩端。其四邊散出紛擾者，便是遊氣，生人物之萬殊。如磨面相似。其四邊只管層層散出。天地之氣
